uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden

Pracinostat (SB939) HDAC remmer

Cat.Nr.S1515

Pracinostat (SB939) is een potente pan-HDAC-remmer met een IC50 van 40-140 nM, met uitzondering van HDAC6. Het heeft geen activiteit tegen het klasse III-iso-enzym SIRT I. Deze verbinding induceert apoptose in tumorcellen. Fase 2.
Pracinostat (SB939) HDAC remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Moleculair gewicht: 358.48

Ga naar

Kwaliteitscontrole

Batch: Zuiverheid: 99.99%
99.99

Celkweek, behandeling & werkconcentratie

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
MCF7 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.17 μM 24119555
NCI-H460 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human NCI-H460 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.22 μM 24119555
HCT116 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.24 μM 24119555
MDA-MB-435 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human MDA-MB-435 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.48 μM 24119555
OVCAR5 cells Proliferation assay 48 h Antiproliferative activity against human OVCAR5 cells after 48 hrs by sulforhodamine B assay, GI50=0.61 μM 24119555
HepG2 Antimalarial assay Antimalarial activity against exo-erythrocytic form of Plasmodium berghei infected in human HepG2 cells, IC50 = 0.15 μM. 24904967
HepG2 Antiplasmodial assay 53 hrs Antiplasmodial activity against exoerythrocytic-stage of Plasmodium berghei ANKA infected in human HepG2 cells after 53 hrs by DAPI staining-based method, IC50 = 0.15 μM. 28241112
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-2 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
HEK293-F Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-8 expressed in HEK293-F cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
Sf9 Function assay 2 hrs Inhibition of recombinant human HDAC-1 expressed in baculovirus infected insect Sf9 cells using Fluor de Lys as substrate preincubated for 2 hrs followed by substrate addition measured after 10 mins by fluorescence assay, Ki = 0.016 μM. ChEMBL
Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken

Chemische informatie, Opslag en Stabiliteit

Moleculair gewicht 358.48 Formule

C20H30N4O2

Opslag (Vanaf de ontvangstdatum)
CAS-nr. 929016-96-6 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles CCCCC1=NC2=C(N1CCN(CC)CC)C=CC(=C2)C=CC(=O)NO

Oplosbaarheid

In vitro
Batch:

DMSO : 72 mg/mL (200.84 mM)
(Met vocht verontreinigde DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Ethanol : 27 mg/mL

Water : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Moleculair gewicht
Verdunningscalculator Moleculair gewicht calculator

In vivo
Batch:

In vivo Formuleringscalculator (Heldere oplossing)

Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme

Kenmerken
A new histone deacetylase inhibitor based on hydroxamic acid, with improved physicochemical, pharmaceutical, and pharmacokinetic properties.
Targets/IC50/Ki
HDAC10
(Cell-free assay)
40 nM
HDAC3
(Cell-free assay)
43 nM
HDAC5
(Cell-free assay)
47 nM
HDAC1
(Cell-free assay)
49 nM
HDAC4
(Cell-free assay)
56 nM
HDAC9
(Cell-free assay)
70 nM
HDAC11
(Cell-free assay)
93 nM
HDAC2
(Cell-free assay)
96 nM
HDAC7
(Cell-free assay)
137 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
140 nM
HDAC6
(Cell-free assay)
1.008 μM
In vitro

Pracinostat (SB939) heeft een 100-voudig hogere selectiviteit voor HDAC's dan voor Zn-bindende niet-HDAC-enzymen, receptoren en ionenkanalen. Deze verbinding is een krachtige remmer van HDAC klasse I-iso-enzymen, HDAC1, HDAC2, HDAC3 en HDAC8 met IC50-waarden variërend van 43 nM tot 140 nM. Het remt HDAC klasse II-iso-enzymen, HDAC4, HDAC5, HDAC7, HDAC9 en HDAC10 significant met IC50-waarden variërend van 40 nM tot 137 nM, met uitzondering van HDAC6 dat een IC50 van 1008 nM vertoont. Het remt HDAC11 van de HDAC klasse IV-enzymen aanzienlijk met een IC50 van 93 nM, maar vertoont geen remmende activiteit tegen SIRT 1 van de klasse III HDAC's. Deze chemische stof vertoont significante antiproliferatieve activiteit tegen een breed scala aan tumorcellijnen, met name leukemiecellen en cutane T-cellymfoomcellen met IC50-waarden variërend van 50 nM (H9-cellen) tot 170 nM (HEL92.1.7-cellen).

Kinase Assay
HDAC-enzymtest
Alle recombinante HDAC-enzymen, met uitzondering van SIRT1, worden gekloond en tot expressie gebracht in S*BIO. De reactiemix die 2,5 of 5 μL van het HDAC-iso-enzym, assaybuffer (25 mM Tris-HCl, pH 7,5; 137 mM NaCl; 2,7 mM KCl, 1 mM MgCl2 en 1 mg/mL BSA), verschillende concentraties van deze verbinding, en het fluorogene deacetylasesubstraat Flour de LysTM bevat in een totaal reactievolume van 33 μL, wordt gedurende 2 uur bij kamertemperatuur geïncubeerd. 16 μL Flour de LysTM-ontwikkelaar wordt toegevoegd en gedurende nog eens 10 minuten geïncubeerd. Het uitgezonden licht wordt gemeten bij 460 nm in een microplaatlezer. IC50-waarden worden gegenereerd met behulp van de XLfit-software.
In vivo

Toediening van deze verbinding (25 mg/kg tot 100 mg/kg) vertoont een dosisafhankelijke antitumorale werkzaamheid in een xenograft-muismodel van humaan colorectaal carcinoom (HCT-116). Dit is ongeveer twee keer zo effectief als SAHA: deze chemische stof veroorzaakt een tumorgroei-inhibitie van 94% versus 48% door SAHA, beide bij de maximaal getolereerde dosis. Orale toediening van dit middel in een dosis van 50 mg/kg of 75 mg/kg in het APCmin genetische muismodel van vroegtijdig darmkanker vermindert het aantal tumoren aanzienlijk, verlaagt de cumulatieve hemocult-scores en verhoogt de hematocrietwaarden effectiever.

Referenties

Toepassingen

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot p-JAK2 / JAK2 / p-STAT5 / STAT5 / p-FLT3 / FLT3
S1515-WB1
22829971

Informatie klinische proef

(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)

NCT-nummer Rekrutering Aandoeningen Sponsor/Medewerkers Startdatum Fasen
NCT02118909 Completed
Healthy Volunteers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA
May 2014 Phase 1
NCT02058784 Completed
Healthy Volunteers|Moderate to Heavy Smokers|Non-smokers
Helsinn Healthcare SA|Celerion
February 2014 Early Phase 1
NCT01112384 Completed
Metastatic Sarcoma
NCIC Clinical Trials Group|S*BIO|Canadian Cancer Trials Group
October 21 2010 Phase 2
NCT00741234 Completed
Solid Tumors|Hematologic Malignancies|Myelodysplastic Syndrome
S*BIO
April 2007 Phase 1

Technische ondersteuning

Gebruiksaanwijzing

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

Als u nog andere vragen heeft, kunt u een bericht achterlaten.

Gelieve uw naam in te voeren.
Gelieve uw e-mailadres in te voeren. Voer een geldig e-mailadres in.
Schrijf alstublieft iets voor ons.