uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden
Cat.Nr.: S7174
Chemische structuur
| Gerelateerde doelwitten | PD-1/PD-L1 CXCR STING AhR Immunology & Inflammation related CD markers Interleukins Anti-infection Antioxidant COX |
|---|---|
| Overige SPHK Inhibitoren | PF-543 hydrochloride SKI II Defensamide (MHP) K6PC-5 SKI-V SKI-178 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Sf9 | Function assay | Inhibition of human recombinant SphK2 expressed in Sf9 cells assessed as radiolabeled products using 10 uM sphingosine and 10 uM gamma[32P]ATP by liquid scintillation counting, Ki=9.8μM | 25643074 | |||
| Sf9 | Function assay | 2 hrs | Inhibition of recombinant human full-length N-terminal His-tagged SK2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using NBD-Sph as substrate measured after 2 hrs by fluorescence based HPLC analysis, Ki=9.8μM | 30889352 | ||
| Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken | ||||||
| Moleculair gewicht | 380.91 | Formule | C23H25ClN2O |
Opslag (Vanaf de ontvangstdatum) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 915385-81-8 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | N/A | Smiles | C1C2CC3(CC1CC(C2)(C3)C(=O)NCC4=CC=NC=C4)C5=CC=C(C=C5)Cl | ||
|
In vitro |
DMSO
: 76 mg/mL
(199.52 mM)
Ethanol : 28 mg/mL Water : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
SphK2
(Cell-free assay) 60 μM
|
|---|---|
| In vitro |
Opaganib (ABC294640) markedly alters the ratio of ceramide/S1P consistent with inhibition of SK activity in MDA-MB-231 cells. It inhibits tumor cell proliferation with IC50 values ranging from approximately 6 to 48 μM, and impairs tumor cell migration concomitant with loss of microfilaments. This compound induces nonapoptotic cell death, morphological changes in lysosomes, formation of autophagosomes, and increases in acidic vesicles in A-498, PC-3, and MDA-MB-231 cells. In both MCF-7 and ER-transfected HEK293 cells, it decreases E2-stimulated ERE-luciferase activity.
|
| Kinase Assay |
Sphingosine Kinase Assays
|
|
De IC50-waarden voor Opaganib (ABC294640) en DMS worden bepaald door een nieuw ontwikkelde HPLC-gebaseerde SK-activiteitsassay. Kort gezegd, de testverbindingen worden geïncubeerd met recombinant SK1 of SK2 en NBD-Sph in de isozym-selectieve assaybuffers zoals hieronder beschreven, met 1 mg/ml vetzuurvrij bovine serumalbumine, 100 μM ATP en 400 μM MgCl2. Het product, d.w.z. NBD-S1P, wordt gescheiden van NBD-Sph door HPLC als volgt: Waters 2795 HPLC-systeem met een Waters 2495 fluorescentiedetector, C8 Chromolith RP-8e kolom (100 × 4,6 mm), 1 ml/min mobiele fase (acetonitril/20 mM natriumfosfaatbuffer, pH 2,5, bij 45:55). Fluorescentie wordt gemeten met excitatie bij 465 nm en emissie bij 531 nm. De verhouding van NBD-S1P/(NBD-Sph + NBD-S1P) wordt gebruikt als maat voor de SK-activiteit. SK-isozym-selectieve assaybuffers bevatten elk 20 mM Tris, pH 7,4, 5 mM EDTA, 5 mM EGTA, 3 mM β-mercapto-ethanol, 5% glycerol, 1× protease-remmers en 1× fosfatase-remmers. Voor de SK1-assaybuffer wordt 0,25% (eindconcentratie) Triton X-100 toegevoegd; en voor de SK2-buffer wordt 1 M (eindconcentratie) KCl toegevoegd. Assays worden 2 uur bij kamertemperatuur uitgevoerd, waarna een 1,5 volume methanol wordt toegevoegd om de kinase-reactie te beëindigen. Na 10 minuten worden de monsters gecentrifugeerd bij 20.000 g om het neergeslagen eiwit af te pelletten, en de supernatanten worden geanalyseerd door HPLC. In experimenten om de Ki voor remming van SK2 door deze verbinding te bepalen, wordt het ADP Quest-assaysysteem gebruikt om de kinase-activiteit te meten in aanwezigheid van variërende concentraties sphingosine en de verbinding. Om de effecten van Opaganib op cellulaire SK-activiteit te bepalen, worden bijna-confluente MDA-MB-231-cellen 's nachts serum-verhongerd en vervolgens behandeld met variërende concentraties van de verbinding. De cellen worden vervolgens geïncubeerd met [3H]sphingosine bij een eindconcentratie van 1 μM. De cellen nemen de exogene sphingosine op, die wordt omgezet in S1P via SK-activiteit, en [3H]S1P wordt gescheiden van [3H]sphingosine door extractie en gekwantificeerd door scintillatietelling.
|
|
| In vivo |
Opaganib (ABC294640) significantly reduces tumor growth in mice bearing mammary adenocarcinoma xenografts, associated with depletion of S1P levels. In severe combined immunodeficient mice bearing A-498 xenografts, it delays tumor growth and elevates autophagy markers. This compound also protects against liver transplantation-induced inflammation and cross-talk between innate and adaptive immunities, major events precipitating and exacerbating graft injury, and improves liver function and survival.
|
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | c-Myc pRb / Rb H3K9ac / p21 p-STAT3 / STAT3 |
|
27517489 |
| Growth inhibition assay | Cell proliferation |
|
25122609 |
(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)
| NCT-nummer | Rekrutering | Aandoeningen | Sponsor/Medewerkers | Startdatum | Fasen |
|---|---|---|---|---|---|
| NCT02939807 | Withdrawn | Carcinoma Hepatocellular |
Medical University of South Carolina|National Cancer Institute (NCI)|Apogee Biotechnology Corporation |
September 30 2019 | Phase 2 |
| NCT03377179 | Completed | Cholangiocarcinoma|Cholangiocarcinoma Non-resectable|Cholangiocarcinoma Perihilar|Cholangiocarcinoma Extrahepatic|Cholangiocarcinoma Intrahepatic |
RedHill Biopharma Limited |
March 7 2018 | Phase 2 |
| NCT02757326 | Terminated | Multiple Myeloma |
RedHill Biopharma Limited|Apogee Biotechnology Corporation|Duke University|National Cancer Institute (NCI) |
December 13 2016 | Phase 1|Phase 2 |
| NCT02229981 | Withdrawn | Diffuse Large B Cell Lymphoma|Kaposi Sarcoma |
RedHill Biopharma Limited|Louisiana State University Health Sciences Center in New Orleans|Apogee Biotechnology Corporation |
July 2014 | Phase 1|Phase 2 |
| NCT01488513 | Completed | Pancreatic Cancer|Unspecified Adult Solid Tumor Protocol Specific |
RedHill Biopharma Limited|Apogee Biotechnology Corporation|Medical University of South Carolina|FDA Office of Orphan Products Development|National Cancer Institute (NCI) |
August 2011 | Phase 1 |