Neomycin sulfate

La néomycine interagit préférentiellement avec le complexe ribozyme-substrat et cette interaction conduit à une réduction du taux de clivage en stabilisant l'état fondamental du complexe et en déstabilisant l'état de transition de l'étape de clivage. [1] La néomycine provoque un changement conformationnel dans la structure de la région trans-activatrice (TAR) qui peut être détecté par spectroscopie de dichroïsme circulaire. La néomycine agit comme un inhibiteur non compétitif qui peut se lier au complexe Tat-TAR et augmenter la constante de vitesse (koff) pour la dissociation du peptide de l'ARN. [2] La néomycine est l'aminoglycoside (lieur de sillon) le plus efficace pour stabiliser une triple hélice d'ADN. La néomycine stabilise le TAT, ainsi que les triplex d'ADN à bases mixtes, mieux que les lieurs de sillon mineur d'ADN connus (qui déstabilisent généralement le triplex) et les polyamines. La néomycine montre une préférence pour la stabilisation des triplets TAT mais peut également accommoder les triplets CGC(+). [3] La néomycine induit un blocage partiel dépendant de la concentration et de la tension, à la fois des faces cytosolique et luminale du canal. La néomycine a une plus grande affinité pour le site d'interaction luminal que pour le site cytosolique : les constantes de dissociation à tension nulle (Kb(0)) sont respectivement de 210,20 nM et 589,70 nM pour le blocage luminal et cytosolique. La néomycine présente également un soulagement du blocage dépendant de la tension à des potentiels de maintien >+60 mV. [4]