Home Cytoskeletal Signaling HDAC Remmer Tubacin

uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden

Tubacin HDAC Remmer

Cat.Nr.: S2239

Tubacin is een zeer krachtige en selectieve, omkeerbare, cel-permeabele HDAC6-remmer met een IC50 van 4 nM in een celvrije test, ongeveer 350-voudige selectiviteit ten opzichte van HDAC1. Deze verbinding vermindert de replicatie van het Japanse encefalitisvirus door de afname van virale RNA-synthese.
Tubacin HDAC Remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Moleculair gewicht: 721.86

Ga naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 99.19%
99.19

Celkweek, behandeling & werkconcentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
mammalian cells Function assay Tested for inhibition of Histone deacetylase 6 induced acetylated tubulin in mammalian cells, EC50=2.9μM 14584932
T24 Function assay Induction of histone H3 acetylation in human T24 cells, EC50=2.9μM 19111466
RAW264.7 Function assay Protection against Bacillus anthracis protective antigen and lethal toxin-diphtheria toxin chimeric protein mediated cytotoxicity in mouse RAW264.7 cells assessed as cell viability 16408003
CHO Function assay Inhibition of Bacillus anthracis anthrax protective antigen heptamer pre-pore to pore conversion in CMG2-expressing CHO cells 23964961
HeLa Function assay 6 hrs Inhibition of HDAC6 in human HeLa cells assessed as reduction in K40 hyperacetylation of alpha-tubulin incubated for 6 hrs by immunofluorescence assay, IC50=2.9μM 25454270
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh18 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh30 cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
A549 Function assay 20 hrs Inhibition of HDAC-6 in human A549 cells assessed as induction of alpha-tubulin acetylation after 20 hrs by cytoblot analysis, EC50=2.5μM ChEMBL
Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken

Chemische informatie, Opslag en Stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Moleculair gewicht 721.86 Formule

C41H43N3O7S

 Opslag (Vanaf de ontvangstdatum)
CAS-nr. 537049-40-4 -- Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles C1C(OC(OC1C2=CC=C(C=C2)CO)C3=CC=C(C=C3)NC(=O)CCCCCCC(=O)NO)CSC4=NC(=C(O4)C5=CC=CC=C5)C6=CC=CC=C6

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 100 mg/mL (138.53 mM)
(Met vocht verontreinigde DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Moleculair gewicht
Verdunningscalculator Moleculair gewicht calculator

In vivo
Batch:

In vivo Formuleringscalculator (Heldere oplossing)

Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Kenmerken
The first known selective inhibitor of α-tubulin deacetylation.
Targets/IC50/Ki
HDAC6
(Cell-free assay)
4 nM
In vitro

Tubacin, without directly stabilizing microtubules, induces an increase in α-tubulin acetylation with EC50 of 2.5 μM in A549 cells. This compound inhibits HDAC6-mediated α-tubulin deacetylation, and inhibits the migration of both wild-type and HDAC6-overexpressing cells. It in combination synergistically enhances tubulin acetylation. This chemical significantly inhibits both drug-sensitive and drug–resistant MM cell growth with IC50 of 5–20 μM, and induces cell apoptosis by activation of caspases.

Kinase Assay
Enzymremmingsanalyse
Enzymremmingsassays worden uitgevoerd met het Reaction Biology HDAC Spectrum-platform. De HDAC1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 en 11-assays maakten gebruik van geïsoleerd recombinant menselijk eiwit; het HDAC3/NcoR2-complex wordt gebruikt voor de HDAC3-assay. Het substraat voor de HDAC1, 2, 3, 6, 10 en 11-assays is een fluorogeen peptide van p53-residuen 379-382 (RHKKAc); het substraat voor HDAC8 is een fluorogeen diacylpeptide gebaseerd op residuen 379-382 van p53 (RHKAcKAc). Acetyl-Lys(trifluoroacetyl)-AMC-substraat wordt gebruikt voor de HDAC4, 5, 7 en 9-assays. Verbindingen worden opgelost in DMSO en getest in 10-dosis IC50-modus met 3-voudige seriële verdunning beginnend bij 30 μM. Controleverbinding Trichostatin A (TSA) wordt getest in een 10-dosis IC50 met 3-voudige seriële verdunning beginnend bij 5 μM. IC50-waarden worden geëxtraheerd door curve-fitting van de dosis/respons-hellingen.
In vivo

In chick embryos, inhibition of HDAC6 activity by Tubacin reduces the formation of new blood vessels in matrigel/nylon mesh. In angioreactors implanted in mice, this compound also impairs the formation of new blood vessels.

Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15937109/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21359602/

Toepassingen (Applications)

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot Acetyl-α-tubulin / α-tubulin / pERK / ERK / p-MLC / MLC
S2239-WB1
26783207
Immunofluorescence p62 / HDAC6 Phalloidin / MYH9 Acetylated Microtubules / Viral HA
S2239-IF1
26643866
Growth inhibition assay Cell viability
S2239-viability1
29845122