uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden
Cat.Nr.S1413
| Gerelateerde doelwitten | CFTR CRM1 CD markers AChR Calcium Channel Sodium Channel Potassium Channel GABA Receptor TRP Channel ATPase |
|---|---|
| Overige Proton Pump Inhibitoren | Ilaprazole Tenatoprazole Revaprazan Hydrochloride Ilaprazole sodium PF-3716556 Ufiprazole |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| human H4 cells | Function assay | 0.4 μM | 24 h | Induction of light chain 3-GFP level in human H4 cells at 0.4 uM after 24 hrs by high throughput fluorescence microscopy relative to control | 18024584 | |
| RAW 264.7 cells | Function assay | 100 nM | Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM | 19307359 | ||
| mouse RAW264.7 cells | Apoptosis assay | 100 nM | 16 h | Induction of apoptosis in mouse RAW264.7 cells assessed as late apoptotic cells at 100 nM after 16 hrs using annexin V-propidium iodide staining by flow cytometry | 19307359 | |
| human HeLa cells | Function assay | 400 nM | Induction of autophagy in human HeLa cells expressing EGFP-LC3 assessed as increase in LC3-2 level at 400 nM | 18391949 | ||
| human MCF7 cells | Function assay | 4 h | Inhibition of rapamycin-induced autophagy in human MCF7 cells expressing EGFP-LC3 assessed as decrease in EGFP levels at 100 nM after 4 hrs by Western blotting relative to control | 20028134 | ||
| RAW 264.7 cells | Bactericidal activity assay | 100 nM | 16 h | Bactericidal activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as decrease in bacterial growth yield at 100 nM after 16 hrs postinfection by flow cytometry in presence of 10 ug/ml of intracellular replication inhi | 19307359 | |
| RAW 264.7 cells | Antimicrobial activity assay | 100 nM | Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM | 19307359 | ||
| RAW 264.7 cells | Antimicrobial activity assay | 100 nM | 30 mins | Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as inhibition of bacterial replication at 100 nM treated 30 mins before infection measured after 2 to 16 hrs postinfection by flow cytometry | 19307359 | |
| rat 3Y1 cells | Function assay | Induction of morphological changes in rat 3Y1 cells assessed as elongation of cells | 29701963 | |||
| human Huh7.5.1 cells | Antiviral activity | 3 h | Antiviral activity against HCV genotype 2a JFH-1 in human Huh7.5.1 cells assessed as reduction of viral entry up to 3 hrs by luciferase assay | 26396683 | ||
| Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken | ||||||
| Moleculair gewicht | 622.83 | Formule | C35H58O9 |
Opslag (Vanaf de ontvangstdatum) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 88899-55-2 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | N/A | Smiles | CC1CC(=CC=CC(C(OC(=O)C(=CC(=CC(C1O)C)C)OC)C(C)C(C(C)C2(CC(C(C(O2)C(C)C)C)O)O)O)OC)C | ||
|
In vitro |
|
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
H+-ATPase
(Cell-free assay) 0.44 nM
|
|---|---|
| In vitro |
Bafilomycin A1 (Baf-A1) is een toxisch macrolide antibioticum afgeleid van Streptomyces griseus, dat de kortsluitstroom remt die wordt geïnduceerd door het buitenste mantel epitheel (OME). De IC50 en maximale remmingsdosis van deze verbinding zijn respectievelijk 0,17 μM en 0,5 μM. Bovendien remt het de zuurinstroom met een IC50-waarde van 0,4 nM. Het remt ook de verzuring dosisafhankelijk, wat resulteert in een lagere quenching en dus een hogere fluorescentie. Deze verbinding voorkomt de vacuolisatie van Hela-cellen geïnduceerd door H. pylori, met een remmende concentratie die 50% van het maximale (ID50) geeft van 4 nM, en is zeer efficiënt in het herstellen van gevacuoliseerde cellen naar een normaal uiterlijk. Het beïnvloedt ook het transport van geëndocyteerd materiaal van vroege naar late endocytische compartimenten, niet alleen door de lage endosomale pH te verdrijven, maar ook door het transport van vroege naar late endosomen in HeLa-cellen te blokkeren. Bij doses van 0,1-1 μM remt het de verzuring van lysosomen volledig, zoals gebleken uit de incubatie met acridine-oranje in BNL CL.2- en A431-cellen. Wanneer toegevoegd aan Hanks' gebalanceerde zoutoplossing, wordt de afbraak van endogene eiwitten sterk geremd en hopen talrijke autofagosomen zich op in H-4-II-E-cellen. Het voorkomt ook het verschijnen van geëndocyteerd HRP in autofagische vacuolen.
|
| Kinase Assay |
ATPase enzymactiviteits assays
|
|
Het ATPase-enzymtestmedium bevat 6 mM MgSO4, 50 mM HEPES (pH 7,4), 200 mM Na2SO3 (V-ATPase activator), 0,5 mM natriumorthovanadaat (P-ATPase inhibitor), 0,5 mM natriumazide (F-ATPase inhibitor) en 3 mM Na2ATP. Dit medium (1,0 ml), met of zonder toevoeging van de V-type ATPase inhibitor Bafilomycin A1 (Baf-A1), wordt gedurende 60 minuten bij 23-25 °C geïncubeerd met het gefilterde homogenaat (0,1 ml). De reactie wordt gestopt door toevoeging van 1 ml TCA 3%. Spectrometrische blanco's worden bereid zoals voor de enzymtest, met uitzondering dat het weefselmonster na het zuur wordt toegevoegd. Fosfaatanalyse wordt uitgevoerd door 2 ml 1-butanol en 0,2 ml molybdaatoplossing (5 g ammoniummolybdaat, 22 ml H2SO4 tot 100 ml) toe te voegen. Na 15 seconden vortexen wordt de oplossing geneutraliseerd met 0,5 ml citraatoplossing (100 g/500 ml, pH 7,0) en opnieuw 15 seconden gevortext. De oplossing wordt vervolgens gecentrifugeerd (2000 × g; 3 minuten) om de butanolfase te scheiden en de absorptie van deze fase wordt afgelezen bij 400 nm. Standaarden van orthofosfaat worden bereid (0,1 μM–2,0 μM) en op dezelfde manier behandeld als de enzymactiviteitstests. Enzymactiviteit wordt uitgedrukt in μmol orthofosfaat vrijgemaakt per uur en per milligram eiwit. V-ATPase activiteit wordt beschouwd als het verschil tussen de totale ATPase activiteit gemeten in aanwezigheid van Na2SO3, natriumorthovanadaat en natriumazide en de ATPase activiteit gemeten in aanwezigheid van deze reagentia en deze verbinding.
|
|
| In vivo |
Bafilomycin A1 (Baf-A1) (1 μM en 0,1 μM) remt de resorptieve activiteit van gekweekte osteoclasten volledig. Deze verbinding remt dosisafhankelijk de snelheid van Na+ opname in jonge tilapia met een Ki van 0,16 μM.
|
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | Ret / EGFR / p75 NGFR |
|
21559479 |
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
20534000 |
| Immunofluorescence | AIF LC3 |
|
25512644 |
| ELISA | TNF-alpha |
|
26240140 |
Vraag 1:
How to dissolve it?
Antwoord:
S1413 is soluble in DMSO at 6 mg/ml. Please do not use alcohols as solvent, because this compound will degrade in alcohols.