Hygromycin B

Hygromycin B heeft één bindingsplaats binnen het 30S, het bevindt zich in de grote groef van de helix zeer dicht bij de spiraalvormige as, en maakt contact met nucleotiden van beide RNA-strengen in de regio 1490-1500 en 1400–1410. Ring I van HygB is betrokken bij niet-sequentie-specifieke interacties met de fosfaat-zuurstofatomen van de ruggengraat van G1494 naast base-specifieke interacties met G1494 en U1495. Ringen II en III vormen zwakke base-specifieke waterstofbruggen met zowel C1404 als U1498, maar hun hoofdfunctie is blijkbaar om ring IV te positioneren voor interactie met basen in het 1496–1498 gebied. Ring IV van HygB bevindt zich binnen 4A van de tweede base van het P-site gebonden mRNA-codon. [1]

Deze verbinding (0,38 mM) stopt de groei van gistcellen volledig in rijke media. Het blokkeert de Polypeptide synthesis sterk in celvrije extracten van konijnenreticulocyten, tarwekiemen en gist. Het remt de peptideketenelongatie door gistpolysomen door elongatiefactor EF-2-afhankelijke translocatie te voorkomen. [2]

Dit antibioticum remt (80%) de elogation-factor-(EF)G-plus-GTP-afhankelijke reactie van ofwel AcPhe-tRNA of natuurlijk peptideyl-tRNA met puromycine in celvrije systemen van Escherichia coli. Het blokkeert de nascnet peptideketens van ofwel gezuiverde endogene E. coli polysomen of poly(uridylic acid)-geprogrammeerde ribosomes tijdens polypeptide synthesis. Het remt de niet-enzymatische translocatie en de afgifte van AcPhe-tRNA van de ribosomale acceptorplaats, bevorderd door uitputting van NH4-ionen. [3]

Het wordt gebruikt voor resistentieselectie in muis L-cellen die getransfecteerd zijn met Escherichia coli-genen die coderen voor resistentie tegen de aminocyclitol antibiotics Hygromycin B. [4]

Deze chemische stof wordt gebruikt als een selecteerbare merker voor T-DNA-transfer en -integratie in de ectomycorrhizale schimmel Suillus bovinus. [5]